Genomsys가 게놈 정보 처리 방식을 어떻게 혁신하고 있는지 알아보세요.
이러한 정보 혁명의 한가운데서 생명 과학의 세계는 변화하고 있습니다. 생명과학은 게놈, 후성유전체, 전사체 등을 나타내는 대규모 데이터 세트의 생성으로 인해 변화했습니다.
크기가 작을 수도 있는 게놈 시퀀싱 기계는 비교적 저렴한 비용으로 더 빠르고 더 빠른 속도로 대량의 게놈 시퀀싱 데이터를 생성할 수 있습니다. 점점 더 큰 게놈 데이터세트를 이용할 수 있게 되면서 의학과 생명과학 분야는 불과 20년 전만 해도 상상할 수 없었던 방식으로 변화했습니다.
더 나은 방향으로 방대한 양의 게놈 데이터 세트가 생성되지만 이러한 빠른 생성은 과학계에 새로운 과제를 가져오고 있습니다. 이러한 과제는 대규모 게놈 데이터 세트의 저장, 처리, 전송, 압축 및 조작과 관련이 있습니다.
이러한 과제를 극복하기 위해 GenomSys는 게놈 데이터의 효율적인 저장, 전송 및 조작을 위한 다양한 장치와 도구를 개발하고 있습니다.
GenomSys: 게놈 정보 표현을 위한 강력한 솔루션 제공
GenomSys가 개발한 장치와 도구는 게놈 정보 표현을 위한 최초의 국제 표준인 ISO/IEC 23092(일명 MPEG-G)를 준수합니다. GenomSys가 개발한 솔루션은 대규모 DNA 데이터 세트에 액세스하고 처리하는 방법을 단순화할 수 있는 최첨단 기능을 갖춘 게놈 애플리케이션을 제공합니다.
다른 장점 중에서도 이러한 솔루션, 도구 및 장치는 데이터 저장 비용과 전송 시간을 획기적으로 줄이기 위해 고안되었습니다. 대규모 게놈 데이터 세트의 이전은 일반적으로 게놈 시퀀싱 센터에서 분석 사이트로 이루어집니다. GenomSys의 솔루션이 무엇을 제공하는지 자세히 알아보기 전에 MPEG-G에 대해 자세히 살펴보겠습니다.
MPEG-G 표준을 간단히 이해하기
MPEG(Moving Picture Experts Group)라고도 알려진 ISO 실무 그룹과 ISO 기술위원회 276 생명공학에 의해 구축된 MPEG-G는 게놈 데이터 처리를 글로벌 규모로 확대하고 국가 전체의 의료 서비스를 개선하는 과제를 해결하기 위해 개발되었습니다. MPEG-G는 또 다른 게놈 데이터 압축 도구일 뿐만 아니라 게놈 시퀀싱 데이터의 효율적인 저장, 전송 및 처리를 위해 완전히 새로운 상호 운용 가능한 애플리케이션 생태계를 구축하기 위한 프레임워크를 제공합니다. MPEG-G는 다섯 부분으로 구성됩니다.
1부에서는 압축된 데이터를 파일 형식으로 캡슐화하고 패킷 네트워크를 통해 전송하는 방법에 대해 설명합니다. 이 부분에서는 압축된 도메인에서 효율적인 검색을 위한 데이터 인덱싱도 다룹니다.
2부는 데이터 압축에 관한 것입니다. MPEG-G의 범위에는 현재 원시 시퀀싱 데이터, 정렬된 데이터 및 참조 시퀀스가 있습니다.
3부는 외부 시스템(MPEG-G와 호환되지 않음)과의 상호 운용성을 위한 표준 인터페이스, 데이터 보호 및 기타 보안 메커니즘 구현을 위한 구문, 메타데이터 인코딩 지원을 지정합니다.
4부에서는 MPEG-G 표준 디코더의 참조 소프트웨어 구현을 제공합니다.
5부에서는 표준에 따라 디코더 구현의 적합성을 평가하는 방법을 지정합니다.
변종, 브라우저 트랙, 게놈 주석, 매트릭스 및 게놈 서열 분석 데이터와 관련된 기타 정보의 표현을 포괄하는 추가 부분이 개발 중입니다.
GenomSys가 제공하는 도구 및 기술의 기능
FASTQ에서 MPEG-G 압축기로.NGS 기계에서 생성된 원시 시퀀싱 데이터는 MPEG-G로 압축되어 원격 분석 센터로 “라이브” 스트리밍될 수 있습니다. 사용 사례에 따라 여러 코딩 모드를 사용할 수 있습니다.
BAM에서 MPEG-G 압축기로.BAM 파일의 기존 리포지토리를 MPEG-G로 인코딩하여 저장 공간과 대역폭을 최대 80% 절약하세요. 필요한 경우 언제든지 원본 BAM 파일로 돌아갈 수 있습니다.
MPEG-G SDK.정렬기 및 변형 호출기와 같은 기존 도구에 MPEG-G 압축, 스트리밍, 선택적 액세스 및 기타 기능을 추가하세요.
MPEG-G-SAM 디코더.GenomSys는 고객이 게놈 서열 분석 데이터의 효율적인 저장, 전송 및 처리를 위한 맞춤형 솔루션을 구축하는 데 도움을 줄 수 있습니다. 고객이 기존 파이프라인을 최적화해야 하는지 아니면 새로운 파이프라인을 구축해야 하는지 GenomSys가 확실히 도와드릴 수 있습니다.
게놈 브라우저.사용자 친화적인 브라우저에서 정렬된 데이터를 시각화하세요. 웹 기반 솔루션과 로컬 독립 실행형 애플리케이션으로 모두 사용 가능합니다.
대량 데이터 스트리밍.클라우드나 원격 스토리지 서버에 시퀀싱 데이터를 자동으로 업로드하세요. 시퀀서에서 생성된 원시 데이터와 기존 원시 또는 정렬된 데이터를 모두 전송할 수 있습니다.
안전한 온라인 저장소. 개인 정보 보호, 무결성 및 액세스 제어를 유지하면서 게놈 데이터를 온라인에 안전하게 저장하세요.